Научно-инженерное предприятие «Геоинформационные системы» было создано в 1996 году Постановлением Бюро Президиума НАН Беларуси от 27 июня 1996 г. № 62 «О создании хозрасчетных научно-инженерных центров Академии наук Беларуси».
В 1996 г. начаты работы в рамках ГНТП «Минимизация и преодоление последствий катастрофы на Чернобыльской АЭС» и ГНТП «Чрезвычайные ситуации» на 1996-2000 гг.
Предприятие принимало участие в программе Союзного государства «Разработка и использование космических средств и технологий получения, обработки и отображения космической информации» («Космос-БР») (1999–2003 гг.).
Предприятие было определено Национальным оператором Белорусской космической системы дистанционного зондирования Земли (далее – БКСДЗ) в целях эксплуатации БКСДЗ и белорусского космического аппарата, а также взаимодействия с организациями, участвующими в исследовании и использовании космического пространства в мирных целях.
В 2006 году создан Центр приема космической информации.
Постановлением Совета Министров Республики Беларусь от 14.10.2008 № 1517 утверждена «Национальная программа исследования и использования космического пространства в мирных целях на 2008 - 2012 годы», включающая подпрограмму «Развитие Белорусской космической системы дистанционного зондирования Земли». В рамках этой подпрограммы предприятием создается инфраструктура и базовые технологии БКСДЗ, обеспечивающие функционирование и эксплуатацию БКА, удовлетворение потребностей пользователей в услугах и данных дистанционного зондирования Земли, как с БКА, так и с перспективных зарубежных космических аппаратов.
22 июля 2012 года был успешно запущен Белорусский космический аппарат.
Предприятие с 2019 года является участником Международной Хартии по космосу и крупным катастрофам.
Предприятие в качестве головной организаций участвовало в выполнении заданий и мероприятий подпрограммы 7 «Исследование и использование космического пространства в мирных целях» государственной программы «Наукоемкие технологии и техника» на 2016–2020 годы и на данный момент в качестве головной организации участвует в выполнении заданий и мероприятий подпрограммы 6 «Исследование и использование космического пространства в мирных целях» государственной программы «Наукоемкие технологии и техника» на 2021–2025 годы.
Основные Партнеры и Заказчики приведены
здесь.